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Département Virologie

Responsable : Yves GAUDIN

Le département mène des recherches en virologie fondamentale. Les deux axes de recherche sont la virologie structurale et de la virologie cellulaire (interactions hôte-virus). Ils s’organisent autour de trois thèmes transversaux qui portent sur les mécanismes de l’entrée du virus, l’assemblage et le transport intracellulaire des particules virales et l’immunité innée.

Présentation générale

Le Département de virologie de l’I2BC accueille six groupes de recherche. Deux axes principaux de recherche sont développés. Le premier est d’interactions hôte-virus. Les équipes impliquées travaillent sur l’identification de facteurs cellulaires ciblés par les protéines virales et sur la caractérisation de leurs interactions. Ces études sont essentielles si on veut déterminer les fonctions de l’hôte qui sont détournées par le virus lors de l’infection de la cellule.

Le second sujet axe porte sur la détermination de la structure atomique des assemblages macromoléculaires formés au cours d’une infection virale. Ces projets combinent cristallographie aux rayons X et microscopie électronique structurale. Ils nécessitent la détermination des conditions qui permettent de piéger des intermédiaires de réaction d’assemblage à des fins d’analyses structurales. Le but ultime de cette approche interdisciplinaire est de fournir une description moléculaire de la dynamique des structures virales à différentes étapes du cycle viral (assemblage du virus, fusion des membranes virale et cellulaire, encapsidation et éjection du génome viral, etc) à un niveau moléculaire.

Les virus étudiés au sein du département sont soit des agents pathogènes importants (virus de la rage, flavivirus, herpèsvirus, rotavirus) ou d’excellents modèles pour la dissection précise des différentes étapes du cycle viral (bactériophage SPP1 et T5, virus de la stomatite vésiculaire).

Le Département se focalise essentiellement sur trois thèmes transverses, étudiés sur plusieurs modèles viraux. Le premier thème porte sur les mécanismes de l’entrée virale. Il est abordé sur des virus infectant des eucaryotes, des bactéries et des archées. Il a conduit à plusieurs publications phares sur la structure des machines virales impliquées dans l’entrée. L’objectif est maintenant de déterminer comment ces machines fonctionnent dans un environnement cellulaire. Le deuxième thème porte sur l’assemblage viral et le transport intracellulaire des particules virales et subvirales. Il est mené à la fois in vivo et in vitro. Nous cherchons à identifier les mécanismes cellulaires détournés par les virions lors de l’entrée, lors du transport intracellulaire, lors de la formation des usines virales, et lors de la sortie de la cellule infectée à la fin du cycle. Enfin, le dernier thème, commun à tous les groupes travaillant sur les virus eucaryotes, porte sur l’immunité innée. Le premier objectif de ce thème est d’identifier la manière dont l’immunité innée est déclenchée lors d’une infection virale et quelles sont les voies de signalisation impliquées. Un deuxième objectif est de caractériser les mécanismes acquis par les virus au cours de l’évolution pour lutter contre les défenses innées de l’hôte.

Les recherches développées dans le département sur les interactions virus-hôte sont clefs pour l’identification de nouvelles cibles et mettre en place de nouvelles stratégies thérapeutiques contre les maladies virales. En outre, la détermination de la structure atomique des protéines virales seules ou en complexe avec des partenaires fournit une base rationnelle pour la conception de petites molécules qui interfèrent avec le cycle viral.

Equipes

1) Bactériophages des bactéries gram positive - Paulo Tavares
2) Bactériophage T5 – Pascale Boulanger
3) Virologie structurale corrélative par cryo-microscopie électronique et radiocristallographie – Jean Lepault
4) Rhabdovirus - Yves Gaudin
5) Biologie Moléculaire des Rotavirus - Didier Poncet
6) Virulence et Latence des Herpesvirus - Audrey Esclatine

publié le , mis à jour le