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Séminaire

  • Biologie Cellulaire

    • Mardi 13 juin 14:00-15:00 - June KWAK - Center for Plant Aging Research Institute for Basic Science, Daegu, Republic of Korea

      Cellular neighbors and precise organ separation

      Lieu : Auditorium - bâtiment 21 - Campus de Gif

      Article

  • I2BC

    • Lundi 12 juin 14:30-15:30 - Andrew CARTER - MRC, Cambridge

      Transporting cargo over long distances : insight from dynein/dynactin structures

      Résumé : Cells depend on components being moved to the correct place at the correct time. My group is interested in cytoplasmic dynein-1 (dynein), a motor which delivers many different cargos via the microtubule network. When dynein is mutated it leads to neurodegeneration and it is susceptible to hijack by viruses which use it to travel into the cell. In the presence of cargo adaptor proteins, such as BICD, dynein binds a cofactor called dynactin. This generates a transporter complex capable of long distance movement along microtubules. We have used cryo-electron microscopy (cryo-EM) to determine a 4.0Å structure of dynactin that explains how this 23 subunit complex is assembled. We subsequently used cryo-EM, in vitro motility assays and in cell assays to determine why dynein is inhibited when it is on its own and how it is activated by binding dynactin. We are now working to understand how the cargo adaptors specifically recruit dynein to dynactin.
      Invité par Julie Ménétrey, équipe Biochimie Structurale des Microtubules, des Kinésines et de leurs Cargos

      Lieu : Auditorium - Bâtiment 21, campus de gif

      Article

    • Mardi 20 juin 11:00-12:00 - Dr Huy Bui - Department of Anatomy and Cell Biology, McGill University, Montreal, Canada

      High-resolution structure of the doublet microtubule reveals new classes of microtubule- associated proteins and insights into its assembly mechanism

      Résumé : Cilia are ubiquitous, hair-like appendages found in eukaryotic cells that carry out functions of cell motility and sensory reception. Cilia contain an intriguing cytoskeletal structure, termed the axoneme, that consists of nine doublet microtubules radially interlinked and longitudinally organized in multiple specific repeat units. Little is known, however, how the axoneme allows cilia to be both actively bendable and sturdy or how it is assembled. To answer these questions, we used cryo-electron microscopy to structurally analyze several of the repeating units of the doublet at subnanometer resolution. This structural detail enables us to unambiguously assign α- and β-tubulins in the doublet microtubule lattice. Our study, for the first time, demonstrates the existence of an inner sheath composed of different kinds of microtubule inner proteins inside the doublet that likely stabilizes the structure and facilitates the specific building of the B-tubule.
      Invité par Anne-Marie Tassin, équipe Biogénese et fonction des structures centriolaires et ciliaires

      Lieu : Auditorium - Bâtiment 21, campus de gif

      Article

Soutenance

  • Microbiologie

    • Vendredi 9 juin 10:30-12:30 - Dr Pascal BELIN - I2BC

      Le déchiffrage des voies de biosynthèse de dicétopipérazines dépendant des synthases de cyclodipeptides : vers de nouvelles molécules bioactives ?

      Résumé : Soutenance HDR
      équipe de Muriel GONDRY : Enzymologie et Biosynthèse Peptidique Non Ribosomale

      Lieu : Salle Schaeffer - Bâtiment 409, Campus d’Orsay

      Article

    • Vendredi 23 juin 14:00-17:00 - Aaron Millan Oropeza - Equipe Métabolisme Energétique des Streptomyces

      Étude comparative du protéome de S. coelicolor M145 et S. lividans TK24, deux souches phylogénétiquement proches ayant des capacités très différentes à accumuler des TAG et à produire des antibiotiques

      Résumé : Les Streptomyces sont des bactéries filamenteuses du sol à Gram +. Elles sont connues pour leur capacité à produire des métabolites secondaires utiles en médecine et en agriculture. S. coelicolor et S. lividans sont des souches modèles phylogénétiquement proches. Elles ont cependant des capacités contrastées à accumuler des lipides de réserve de la famille des triacylglycérol (TAG) et produire des métabolites secondaires alors qu’elles possèdent des voies de biosynthèse similaires pour ces deux types de molécules.
      En présence de glucose, S. coelicolor produit des niveaux élevés de métabolites secondaires spécifiques et son contenu en TAG est faible alors que c’est le contraire chez S. lividans. protéomique du métabolisme de ces deux souches modèles en présence de glycérol. En revanche, en présence de glycérol, les deux souches accumulent une quantité de TAG similaire mais S. coelicolor produit aussi des métabolites secondaires.
      Le but de la présente thèse était de déterminer les caractéristiques métaboliques différentielles qui sous-tendent les différentes capacités biosynthétiques de ces deux souches modèles. Pour ce faire, une analyse protéomique comparative sans marquage des souches cultivées en milieu R2YE liquide ou solide en présence de glucose ou de glycérol comme principales sources de carbone a été réalisée en utilisant la technique de chromatographie liquide couplée à de la Spectrométrie de Masse en tandem (LC-MS / MS). Au total, 2024 et 4372 protéines ont été identifiées à partir des cultures liquides et solides, représentant 24% et 50% du protéome théorique.
      Les études en liquide ont révélé que le métabolisme de S. lividans était principalement glycolytique alors que le métabolisme de S. coelicolor était principalement oxydatif. Elles ont également indiqué que ces caractéristiques pourraient être liées au catabolisme préférentiel des acides aminés par rapport au glucose de S. coelicolor contrairement à S. lividans qui catabolise préférentiellement le glucose. Par ailleurs cette thèse constitue la première analyse protéomique du métabolisme de ces deux souches modèles en présence de glycérol et a révélé un grand nombre de protéines impliquées dans le métabolisme lipidique. Les données protéomiques générés au cours de cette thèse, qui seront mis à la disposition du public, sont susceptibles de stimuler de nouvelles recherches visant à mieux comprendre le fonctionnement métabolique des souches sur-productrices d’antibiotiques.

      Lieu : Salle Kalogeropoulos - Bâtiment 400, Campus d’Orsay

      Article

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