Rechercher






Nos tutelles

CNRS

Nos partenaires


Accueil > Plateformes > Séquençage à haut débit

Séquençage à haut débit

Présentation de la Plateforme de Séquençage à haut débit

ATTENTION ! Notre plateforme a déménagé. Désormais vous pouvez nous trouver au bâtiment 26 du campus de Gif-sur-Yvette, 1er étage, porte 104
La plateforme de Séquençage à haut débit a été créée en (...)

Lire la suite

Prestations proposées

Les prestations offertes par la plateforme sont :
Construction de banques :
Banques classiques et mate-pair à partir d’ADN génomique
RNA-seq, small RNA-seq
ChIP-seq, MeDIP-seq
Protocoles (...)

Lire la suite

Tarifs

A noter :
la plateforme propose maintenant à ses utilisateurs de séquencer leurs échantillons sur le séquenceur MinION d’Oxford Nanopore Technologies, dans le cadre de projets collaboratifs. Vous (...)

Lire la suite

Fiches prestations

La plateforme propose à ses utilisateurs de séquencer leurs échantillons sur un MinION, dans le cadre de projets collaboratifs. Merci de nous contacter pour toute demande. Fiche prestation MiSEQ (...)

Lire la suite

Instructions pour la préparation des échantillons

Please read carefully these guidelines before preparing your material for sequencing
Samples should be in 1.5mL or 2mL tubes.
Write distinctly the sample codes received with your quote on the (...)

Lire la suite

Equipements

1 séquenceur Oxford Nanopore Technologies : MinION ;
2 séquenceurs de types Illumina : NextSeq 500 et MiSeq ;
Covaris sonicator, Bioanalyzer, Qubit, robot Beckman Coulter SPRIworks ;
un (...)

Lire la suite

Les membres

Le personnel de la plateforme est constitué de :
Un directeur scientifique : Claude THERMES
Un directeur technique : Erwin VAN DIJK
2 ingénieurs pour la construction et le séquençage des (...)

Lire la suite

Les publications

2014 : Ten years of next-generation sequencing technology. van Dijk EL, Auger H, Jaszczyszyn Y, Thermes C. Trends Genet. 2014 Sep ;30(9):418-426
CIRCUS : a package for Circos display of (...)

Lire la suite

Les outils bioinformatiques

CIRCUS is an R package implemented to analyze genomic structural variations. It generates both data and configuration files necessary for Circos, to produce graphs.
You can find the related (...)

Lire la suite

Nous contacter / Où nous trouver !

Pour l’envoi des échantillons : Plateforme de Séquençage Haut Débit I2BC- UMR9198 c/o Magasin de l’I2BC CNRS, Bât. 30 Avenue de la Terrasse 91198 Gif-sur-Yvette France
Adresse postale / Où déposer (...)

Lire la suite