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Accueil > Départements > Biochimie, Biophysique et Biologie Structurale > Stéphane BRESSANELLI : Interactions et mécanismes d’assemblage des protéines et des peptides

Virologie Structurale

Dans cet axe l’équipe développe des collaborations avec des groupes de virologie moléculaire et cellulaire. Notre but est de promouvoir l’utilisation de l’outil et des analyses structurales par les biologistes. Nos méthodes principales, la cristallographie aux rayons X et la cryo-microscopie électronique, nous permettent de déterminer la structure à l’échelle atomique de composants des virus. Nous nous intéressons au premier chef aux complexes de réplication viraux, ces complexes multiprotéiques codés dans le génome des virus et qui synthétisent de nouvelles copies de celui-ci à l’intérieur des cellules hôtes (Bressanelli, Science 2015 ; Jupin et al., PLoS Path. 2017 ; Ben Ouirane et al., J Biol Chem 2019).

Virologie Structurale
Virologie Structurale

Les protéines et enzymes dans ces complexes sont des cibles pour des antiviraux spécifiques, qui peuvent être découverts et surtout améliorés grâce à l’analyse structurale. De même nos études fondamentales sur les processus physico-chimiques sous-tendant l’auto-assemblage de capsides virales (Tresset et al., J. Am. Chem. Soc. 2013 ; Law-Hine et al., J. Phys. Chem. Lett. 2015 ; Chevreuil et al., Nature Commun. 2018) et la façon dont les virus enveloppés déclenchent le franchissement des membranes cellulaires (Baquero et al., PLoS Pathogens 2015 ; EMBO J. 2017) ont des retombées dans ce qu’on appelle la conception rationnelle de médicaments. Notre but premier cependant est la compréhension des processus fondamentaux qui président à la réplication des génomes viraux.

Publications

  1. Ben Ouirane K, Boulard Y, Bressanelli S. The hepatitis C virus RNA-dependent RNA polymerase directs incoming nucleotides to its active site through magnesium-dependent dynamics within its F motif. J. Biol. Chem. 2019. 294 : 7573–7587.
  2. Chevreuil M, Law-Hine D, Chen J, Bressanelli S, Combet S, Constantin D, Degrouard J, Möller J, Zeghal M, Tresset G. Nonequilibrium self-assembly dynamics of icosahedral viral capsids packaging genome or polyelectrolyte. Nat Commun. 2018. 9 : 3071.
  3. Lecoq L, Wang S, Wiegand T, Bressanelli S, Nassal M, Meier B H, Böckmann A. Localizing Conformational Hinges by NMR : Where Do Hepatitis B Virus Core Proteins Adapt for Capsid Assembly ? Chemphyschem. 2018. doi:10.1002/cphc.201800211
  4. Jupin, I. ; Ayach, M. ; Jomat, L. ; Fieulaine, S. ; Bressanelli, S. A Mobile Loop near the Active Site Acts as a Switch between the Dual Activities of a Viral Protease/Deubiquitinase. PLoS Pathog. 2017, 13 (11), e1006714.
  5. Tubiana, T. ; Boulard, Y. ; Bressanelli, S. Dynamics and Asymmetry in the Dimer of the Norovirus Major Capsid Protein. PLoS ONE 2017, 12 (7), e0182056.
  6. Doerflinger, S. Y. ; Cortese, M. ; Romero-Brey, I. ; Menne, Z. ; Tubiana, T. ; Schenk, C. ; White, P. A. ; Bartenschlager, R. ; Bressanelli, S. ; Hansman, G. S. ; et al. Membrane Alterations Induced by Nonstructural Proteins of Human Norovirus. PLoS Pathog. 2017, 13 (10), e1006705.
  7. Baquero, E. ; Albertini, A. A. ; Raux, H. ; Abou-Hamdan, A. ; Boeri-Erba, E. ; Ouldali, M. ; Buonocore, L. ; Rose, J. K. ; Lepault, J. ; Bressanelli, S. ; Gaudin, Y. Structural Intermediates in the Fusion-Associated Transition of Vesiculovirus Glycoprotein. EMBO J. 2017, 36 (5), 679–692.
  8. Karakas, E. ; Taveneau, C. ; Bressanelli, S. ; Marchi, M. ; Robert, B. ; Abel, S. Derivation of Original RESP Atomic Partial Charges for MD Simulations of the LDAO Surfactant with AMBER : Applications to a Model of Micelle and a Fragment of the Lipid Kinase PI4KA. J. Biomol. Struct. Dyn. 2017, 35 (1), 159–181.
  9. Law-Hine, D. ; Zeghal, M. ; Bressanelli, S. ; Constantin, D. ; Tresset, G. Identification of a Major Intermediate along the Self-Assembly Pathway of an Icosahedral Viral Capsid by Using an Analytical Model of a Spherical Patch. Soft Matter 2016, 12 (32), 6728–6736.
  10. Akil, A. ; Peng, J. ; Omrane, M. ; Gondeau, C. ; Desterke, C. ; Marin, M. ; Tronchère, H. ; Taveneau, C. ; Sar, S. ; Briolotti, P. ; Benjelloun, S. ; Benjouad, A. ; Maurel, P. ; Thiers, V. ; Bressanelli, S. ; Samuel, D. ; Bréchot, C. ; Gassama-Diagne, A. Septin 9 induces lipid droplets growth by a phosphatidylinositol-5-phosphate and microtubule-dependent mechanism hijacked by HCV. Nat Commun 2016, 7, 12203.
  11. Valéry, C. ; Deville-Foillard, S. ; Lefebvre, C. ; Taberner, N. ; Legrand, P. ; Meneau, F. ; Meriadec, C. ; Delvaux, C. ; Bizien, T. ; Kasotakis, E. ; Lopez-Iglesias, C. ; Gall, A. ; Bressanelli, S. ; Le Du, M.-H. ; Paternostre, M. ; Artzner, F. Atomic View of the Histidine Environment Stabilizing Higher-pH Conformations of pH-Dependent Proteins. Nat Commun 2015, 6, 7771.
  12. Taveneau, C. ; Blondeau, K. ; Bressanelli, S. Definition and Expression in E. Coli of Large Fragments from the Human Lipid Kinase Phosphatidylinositol 4-Kinase Type III Alpha, and Purification of a 1100-Residue N-Terminal Module. Protein Expr. Purif. 2015, 114, 121–127.
  13. Scrima, N. ; Lepault, J. ; Boulard, Y. ; Pasdeloup, D. ; Bressanelli, S. ; Roche, S. Insights into Herpesvirus Tegument Organization from Structural Analyses of the 970 Central Residues of HSV-1 UL36 Protein. J. Biol. Chem. 2015, 290 (14), 8820–8833.
  14. Law-Hine, D. ; Sahoo, A. K. ; Bailleux, V. ; Zeghal, M. ; Prevost, S. ; Maiti, P. K. ; Bressanelli, S. ; Constantin, D. ; Tresset, G. Reconstruction of the Disassembly Pathway of an Icosahedral Viral Capsid and Shape Determination of Two Successive Intermediates. J Phys Chem Lett 2015, 6 (17), 3471–3476.
  15. Bressanelli, S. Kickstarting a Viral RNA Polymerase. Science 2015, 347 (6223), 715–716.
  16. Baquero, E. ; Albertini, A. A. ; Raux, H. ; Buonocore, L. ; Rose, J. K. ; Bressanelli, S. ; Gaudin, Y. Structure of the Low pH Conformation of Chandipura Virus G Reveals Important Features in the Evolution of the Vesiculovirus Glycoprotein. PLoS Pathog. 2015, 11 (3), e1004756.
  17. Ayach, M. ; Bressanelli, S. Crystallization of Mutants of Turnip Yellow Mosaic Virus Protease/ubiquitin Hydrolase Designed to Prevent Protease Self-Recognition. Acta Cryst. F 2015, 71 (Pt 4), 405–408.
  18. Rieille, N. ; Bressanelli, S. ; Freire, C. C. ; Arcioni, S. ; Gern, L. ; Péter, O. ; Voordouw, M. J. Prevalence and Phylogenetic Analysis of Tick-Borne Encephalitis Virus (TBEV) in Field-Collected Ticks (Ixodes Ricinus) in Southern Switzerland. Parasit Vectors 2014, 7 (1), 443.
  19. Harak, C. ; Radujkovic, D. ; Taveneau, C. ; Reiss, S. ; Klein, R. ; Bressanelli, S. ; Lohmann, V. Mapping of Functional Domains of the Lipid Kinase Phosphatidylinositol 4-Kinase Type III Alpha Involved in Enzymatic Activity and Hepatitis C Virus Replication. J. Virol. 2014, 88 (17), 9909–9926.
  20. Duriez, M. ; Thouard, A. ; Bressanelli, S. ; Rossignol, J.-M. ; Sitterlin, D. Conserved Aromatic Residues of the Hepatitis B Virus Precore Propeptide Are Involved in a Switch between Distinct Dimeric Conformations and Essential in the Formation of Heterocapsids. Virology 2014, 462-463C, 273–282.

Contact


BRESSANELLI Stéphane [Directeur de Recherche - CNRS]
Interactions et mécanismes d’assemblage des protéines et des peptides [Responsable]
01 69 08 40 58 Saclay - Bât 532

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