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Offre d’emploi Ingénieur de Recherche CNRS pour la plateforme de séquençage de l’I2BC

Un poste d’Ingénieur(e) de Recherche en bio-informatique est ouvert à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC). Spécialisé(e) en génomique, l’ingénieur(e) sera responsable scientifique de la
Plateforme de Séquençage PSI2BC et dirigera le groupe de bio-informatique chargé du traitement des données des projets de séquençage réalisés par la plateforme (technologies Illumina et Oxford Nanopore). Il (elle) concevra et conduira des développements d’outils bio-informatiques innovants pour
suivre l’évolution rapide des techniques de séquençage notamment autour de la molécule unique (ADN et ARN), des bases modifiées, et ultérieurement de la cellule unique. Il (elle) assurera le suivi des projets en lien avec les utilisateurs et orientera les choix sur les méthodes et les outils adaptés aux
questions biologiques posées. Il (elle) animera un réseau d’échange de compétences en bio-informatique au sein de l’unité et contribuera au co-encadrement ou à la formation d’étudiants et de membres d’équipes de recherche.
Date de début du poste : fin 2019.
Les candidat(e)s titulaires d’une thèse ou d’un diplôme d’Ingénieur sont invité(e)s à postuler sur le site du CNRS, 2ème poste du concours n°53 (BAP E) :
http://www.dgdr.cnrs.fr/drhita/concoursita/consulter/resultats/consulter.htm

Description de la plateforme :
L’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) est une Unité Mixte de Recherche du CNRS (UMR9198), CEA et Université Paris-Sud, constituée de 73 équipes de recherche et de 14 plateformes technologiques. L’institut a une forte activité en bio-informatique, en biologie computationnelle et en
génomique, et possède une plateforme dédiée au séquençage et à l’analyse des données (PSI2BC).
Celle-ci est certifiée ISO9001 (NFX-50-900) et est ouverte aux laboratoires académiques et aux industriels. Elle est constituée d’une équipe de biologistes assurant la préparation et le séquençage des échantillons et d’une équipe de bio-informatique en charge de l’analyse des données de
séquençage. Ces équipes assurent de façon coordonnée et en lien étroit avec les utilisateurs, le suivi des projets depuis leur mise en place jusqu’à leur réalisation complète. La plateforme réalise une grande variété de projets de génomique (plus de 200 projets/an) avec la technologie Illumina, et avec
la technologie Oxford Nanopore pour le séquençage direct d’ADN et d’ARN. Elle est également fortement engagée dans la détection des bases modifiées (ADN, ARN) et souhaite développer des approches autour de la cellule unique.
L’I2BC est situé à Gif-sur-Yvette dans le campus du CNRS (Vallée de Chevreuse, Essonne), à côté de l’Université Paris-Saclay, à environ 20 km au sud de Paris avec des liaisons directes RER (40 mn).

Compétences souhaitées :
• Expérience approfondie en gestion de grands volumes de données, avec au moins 3 à 5 ans d’expérience en génomique et traitement des données NGS
• Maîtrise parfaite de Unix/Linux, R, et plusieurs langages de programmation ainsi que des connaissances en gestion et administration de bases de données
• Maîtrise des technologies de séquençage à haut débit
• Maîtrise de la biologie moléculaire
• Capacité à élaborer des outils d’analyse et de synthèse
• Techniques de management d’équipe (encadrement d’ingénieurs)

Pour plus d’informations :
Description du poste
Institut de Biologie Intégrative de la Cellule
Plateforme de Séquençage de l’I2BC

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par Communication - publié le