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Offres d’emploi

One-year Postdoctoral position
A one-year postdoctoral position funded by DIM1 Health (Région Ile-de France) starting beginning of 2021 is available in the research group "Transcription regulation in the malaria parasite" to work on characterization of a nuclear protein complex from Plasmodium falciparum.
The postdoctoral researcher will work in a project combining parasitology, proteomics and biochemistry, as part of a new ATIP-Avenir team at the Genome Biology department of the I2BC. The goal of the project is to determine how two essential nuclear proteins from the malaria parasite, Plasmodium falciparum, interact to then design protein complex inhibitors. The postdoc will collaborate with two teams, one from the I2BC and one from IPSIT, to reach the project goals.

The I2BC is a University of Paris-Saclay/CNRS/CEA research unit situated in the research campus of Gif-sur-Yvette, 35km southwest of Paris. The campus is in close proximity to a natural park and is deserved by public transportation with direct access to Paris. The institute hosts around 750 people among 60 research teams and 14 state-of-the-art technical facilities.

To apply, please send a letter of motivation, CV and the coordinates of 2 referees to Joana Santos.


Two-years Postdoctoral position

A two-year postdoctoral position funded by the French National Research Agency (ANR) is available at the research group of « Intracellular Trafficking and Organelle Biogenesis of Toxoplasma » in the Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC), UMR 9198 CNRS-CEA, and Paris-Saclay University (South Paris University). Our group is interested in the intracellular trafficking of proteins and lipids that are involved in the biogenesis of secretory organelles known to play key roles in infection of hosts by Toxoplasma gondii. The current project will focus on the functional analyses of newly identified parasite’s proteins that bind to lipids, which are likely involved in the membrane trafficking from the post-Golgi/endosome-like compartement (ELC) to the secretory organelles of T. gondii. By using a combination of approaches including cell biology and biochemistry, we aim to decipher the roles of these novel proteins in the formation of membrane-bound vesicles that are required for secretory organelle biogenesis.

The applicant should have a strong background in cell and molecular biology. Prior experience in imaging (confocal microscopy) analyses and biochemical methods to study protein-protein (IP) will be highly advantageous. The ideal candidate should be highly motivated, curious and will be actively involved in interdisciplinary research with renowned laboratories and core facilities of the Institute for Integrative Biology of the Cell (I2BC). A good level in English (written and spoken) is required. Review of applications will begin immediately until the position filled.

Interested candidates should send by e-mail their CV, a list of two or three references and a cover letter stating their research experience and interests to Dr Stanislas Tomavo



Poste de gestion et management qualité Plateforme de Séquençage de l’I2BC

Résumé :
Un CDD en Gestion administrative et Management de système qualité est ouvert à la Plateforme de Séquençage de l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC). Le poste est ouvert au niveau d’Assistant Ingénieur. Les activités sont focalisées sur la gestion et la comptabilité des projets de séquençage traités par la plateforme ainsi que sur le management du système Qualité en place.

L’Institut :
L’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC) est une Unité Mixte de Recherche (UMR 9198) du CNRS, CEA et Université Paris-Saclay, constituée de 60 équipes de recherche et de 14 plateformes technologiques. L’institut possède une plateforme (PSI2BC), dédiée au séquençage et à l’analyse des données. L’I2BC est situé à Gif-sur-Yvette sur le campus du CNRS (Vallée de Chevreuse, Essonne), à côté de l’Université Paris-Saclay à environ 20 km au sud de Paris avec des liaisons directes RER (40 mn).

La plateforme :
La plateforme est composée de 1 responsable et 7 ITA. Elle est totalement ouverte aux communautés académique et industrielle et réalise une grande variété de projets de génomique : DNA-seq, RNA-seq, small RNA-seq (technologie Illumina), et depuis peu le séquençage direct d’ADN et d’ARN avec le séquenceur GridION (Oxford Nanopore). La plateforme assure la conception et le suivi des projets et traite environ 200 projets/an. La plateforme est certifiée ISO 9001 depuis 2015 et NFX 50-900 depuis 2017.

Missions :
Les missions de l’ingénieur(e) seront : (i) sous la direction des responsables de la plateforme, d’assurer la gestion et le suivi administratif des projets de séquençage en liaison avec les utilisateurs, (ii) d’assurer la rédaction et la gestion des devis, (iii) de gérer la comptabilité et les commandes de la plateforme, (iv) d’assurer les fonctions de Responsable Management Qualité (RMQ) pour l’ensemble des activités de la plateforme.

Compétences et diplômes :
- Expérience en gestion et comptabilité
- Expérience dans la mise en œuvre et le suivi d’une démarche Qualité
- Connaissance souhaitée des principes du séquençage de l’ADN
- Sens du relationnel et du travail en équipe
- Maîtrise de l’anglais parlé et écrit
- Titulaire d’un diplôme BAC+2

Durée : 1 an renouvelable
Les salaires sont conformes aux grilles du CNRS, suivant l’expérience. Le poste est disponible dès que possible.
Les candidat(e)s sont invité(e)s à postuler directement sur le portail emploi du CNRS à l’adresse suivante :
https://emploi.cnrs.fr/Offres/CDD/UMR9198-CLATHE-002/Default.aspx

Pour plus d’informations visitez la page de la Plateforme de Séquençage de l’I2BC


Two-year post-doctoral position
A 2-year post-doc position (funded by ANR Jeune Chercheur Jeune Chercheuse) is available from summer 2020 in the new team of Angélique Déléris to explore the epigenetic regulation of transposable elements in Arabidopsis thaliana in particular after their activation by biotic stress.
The study will use a wide range of technologies in epigenetics, molecular biology and cytology.
The Genome Biology department of I2BC has a long-standing expertise in cell biology, molecular biology, genomics, genetics, biochemistry, and studies a variety of models among which Arabidopsis thaliana. The institute has ten in house technological platforms, including DNA sequencing, bioinformatics, proteomics, imaging, plant culture, etc....It is located within the campus of CNRS in Gif-sur-Yvette, about 45 minutes south of Paris.
We are looking for independent researchers with good communication skills, who are open minded, and with a good team spirit. A strong background in molecular biology techniques is required ; a background in plant epigenetics or gene regulation is preferred. Experience with cell imaging would be helpful, but is not required. A computational background (or willingness to learn basic computational methods) is also a plus.
This offer will appear formerly in CNRS Job news at https://emploi.cnrs.fr.
Application, including a detailed CV, a brief summary of research interests, and names and addresses of two referees, could already be addressed by mail to Angélique Déléris



Poste d’assistant ingénieur disponible à l’ I2BC, Gif Sur Yvette (à 20 km de Paris - FRANCE)

Un poste d’assistant ingénieur de 12 mois est disponible à partir de début 2020 pour étudier les machines plastidiales impliquées dans la maturation de RbcL dans le groupe « Maturation des protéines, Destiné cellulaire et thérapeutique » à l’I2BC à Gif Sur Yvette (https://www.i2bc.paris-saclay.fr/spip.php?article1).

Contexte
Les chloroplastes (Cp) ont évolué à partir de procaryotes engloutis, très probablement des cyanobactéries qui vivaient autrefois comme des organismes indépendants. Ainsi, pour de nombreux aspects, les chloroplastes ressemblent beaucoup plus aux bactéries. Néanmoins, le nouveau résident cellulaire a rapidement évolué en acquérant des caractéristiques originales et uniques telles que la perte ou le déplacement de la majorité des gènes dans le noyau de l’hôte, alors qu’il ne restait que 80 gènes codant pour une protéine dans l’organelle.
Toutes les protéines localisées dans les chloroplastes codées par le génome nucléaires ou par le génome du plaste subissent de nombreuses modifications co-et post-traductionnelles (CTM et PTM). Cela implique que les deux types de modifications peuvent fournir un contrôle substantiel de la stabilité, de l’accumulation, de l’activité, de l’assemblage et de la compartimentation. Cependant, les CTM et les PTM des protéines plastidiques et de leurs modificateurs catalytiques n’ont pas été explorés de manière intensive à ce jour. Cela est particulièrement vrai pour les modifications de protéines N-terminal (NPM).
Le NPM le plus ancien est l’excision essentielle de la méthionine N-terminale (NME). L’NME correspond à l’élimination du premier acide aminé incorporé dans une chaîne peptidique naissante (iMet). Dans les plastes, les MetAP, les modificateurs spécifiques responsables de l’excision iMet, assurent l’NME. Néanmoins, un certain nombre d’exceptions aux règles NME établies existent dans le plaste, ce qui suggère que les pMetAP pourraient fonctionner différemment des MetAP caractérisés précédemment. Il convient de noter que le mécanisme de maturation le plus inhabituel et complexe du N-ter de l’une des sous-unités (RbcL) de l’enzyme RuBisCO, qui est le composant majeur du cycle de Calvin-Benson et la protéine la plus abondante sur Terre, est encore une énigme depuis des décennies ainsi que son implication sur l’activité, l’assemblage, la localisation ou l’interaction avec des partenaires de RubisCO.

Projet
L’objectif de ce projet d’un an est d’élucider les machines plastidiques uniques impliquées dans la maturation de la RbcL. Pour ce projet, nous recherchons un assistant ingénieur possédant une solide expertise en biologie moléculaire, en biochimie des protéines et en enzymologie. Une expérience dans les techniques ciblées par spectrométrie de masse,d’ enrichissement de la modification post-traductionnelle sera apprécié. La personne sélectionnée sera chargée de la caractérisation biochimique des modificateurs de MNP et de l’analyse de l’impact des MNP sur RuBiscCO chez E. coli. La personne recrutée sera formée à l’utilisation de nos pipelines / méthodes internes pour la caractérisation et la quantification N-terminales par protéomique, l’évaluation enzymatique NAT et MetAP et l’analyse d’échantillons de partenaires par MS. Le candidat retenu devra être capable de réaliser les expériences de manière autonome, d’analyser et d’interpréter les données émergentes. Le candidat idéal devrait être très motivé et capable d’avoir un sens aigu des relations et de l’organisation. La maîtrise de l’anglais est préférable.

Pour plus d’informations, veuillez contacter :
Carmela GIGLIONE

Carmela Giglione PhD
Maturation des protéines, devenir des cellules et thérapeutique
Institut de biologie intégrative de la cellule (I2BC)
CNRS UMR9198, Bâtiment 21, 1 avenue de la Terrasse
F-91198 Gif-sur-Yvette Cedex, France
Courriel : carmela.giglione i2bc.paris-saclay.fr
Tel : 01 69 82 46 44
http://www.i2bc.paris-saclay.fr/spip.php?article130

Pour postuler, il faut :
• un CV
• Coordonnées complètes d’au moins deux références

Sélection de publications de l’équipe :
- Castrec B, et al (2018) Structural and genomic decoding of human and plant myristoylomes reveals a definitive recognition pattern. Nat Chem Biol 14 : June 11, DOI : 10.1038/s41589-018-0077-5
- Majeran W, et al (2018) Targeted profiling of A. thaliana sub-proteomes illuminates new co- and post-translationally N-terminal Myristoylated proteins. Plant Cell 30 : 543–562
- Bienvenut WV, Giglione C, Meinnel T (2015) Proteome-wide analysis of the amino terminal status of Escherichia coli proteins at the steady-state and upon deformylation inhibition. Proteomics 15 : 2503-18
- Bienvenut WV, Giglione C, Meinnel T (2017) SILProNAQ : A Convenient Approach for Proteome-Wide Analysis of Protein N-Termini and N-Terminal Acetylation Quantitation. Methods Mol Biol 1574 : 17-34
- Bienvenut WV, et al (2017) EnCOUNTer : a parsing tool to uncover the mature N-terminus of organelle-targeted proteins in complex samples. BMC Bioinformatics 18 : 182
- Linster E., et al (2015) Downregulation of N-terminal acetylation triggers ABA-mediated drought responses in Arabidopsis. Nat Commun 6 : 7640
Xu F., et al (2015) Two N-terminal acetyltransferases antagonistically regulate the stability of a nod-like receptor in Arabidopsis. Plant Cell 27 : 1547-62
- Dinh, T.V et al (2015) Molecular identification and functional characterization of the first Nα-acetyltransferase in plastids by a global acetylome profiling test, Proteomics, 15, 2426-2435
- Bienvenut, W.V., et al (2012) Comparative large-scale characterisation of plant vs. mammal proteins reveals similar and idiosyncratic N-alpha acetylation features. Mol. Cell. Proteomics, 11 : M111 015131



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Vous pouvez toutefois joindre directement la personne identifiée comme contact dans l’équipe qui vous intéresse si vous souhaitez déposer une candidature spontanée.

par Communication - publié le , mis à jour le