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Accueil > Départements > Biologie des Génomes > Fabienne MALAGNAC : Epigénétique et Développement chez les Champignons

Fabienne MALAGNAC : Présentation de l’équipe

En plus des gènes nécessaires au fonctionnement cellulaire, on trouve dans les génomes des séquences d’ADN dite « égoistes » parce qu’elles sont capables de se déplacer et de se multiplier de manière autonome, et qu’elles ne contribuent pas à la physiologie de leur hôte. Ces séquences, parfois présentes en plusieurs dizaines de milliers de copies et potentiellement source d’instabilité génomique peuvent donc être considérées comme un fardeau génomique. Pour s’en protéger, certains champignons filamenteux, dont l’organisme modèle Podospora anserina, ont recours à un mécanisme appelé RIP pour « Repeat-Induced Point mutation ». Lors de la reproduction sexuée, des mutations sont introduites dans les séquences d’ADN répétées et l’expression transcriptionnelle des gènes qu’elles contiennent est abolie de manière réversible. Les séquences qui ont été la cible du RIP montrent également des marques typiques des régions hétérochromatiques. Chez d’autres champignons filamenteux, tel qu’Ascobolus immersus, seules des modifications épigénétiques sont apposées sur les séquences répétées (MIP, methylation induite préméiotiquement).

Asques d'Ascobolus immersus
Asques d’Ascobolus immersus
Inactivation via MIP d’un gène impliqué dans la coloration des spores (asque à huit ascospores blanches)
Podospora anserina
Podospora anserina
Jeunes asques en formation

En utilisant des approches génétiques, génomiques et cellulaires, nos recherches visent à comprendre comment le RIP et le MIP fonctionnent et quelles en sont les conséquences sur la physiologie des organismes chez qui ils opèrent. En particulier, en tirant parti des propriétés de ces organismes modèles, nous cherchons à explorer les liens entre les mécanismes épigénétiques de régulation de l’expression génique et la reproduction sexuée.

par Communication - publié le