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Accueil > Départements > Biologie des Génomes > Daan NOORDERMEER : Dynamique de la Chromatine

Équipe Dynamique de la Chromatine

Comment la structure de la chromatine influence l’activité des gènes ? L’équipe Dynamique de la Chromatine étudie cette question en reliant épigénétique et organisation tridimensionnelle de l’ADN en utilisant des approches de biologie des systèmes. Quatre projets sont en cours actuellement : (1) la dynamique de la structure de l’ADN au cours du cycle de vie des mammifères et pendant la carcinogenèse, (2) l’organisation tridimensionnelle des domaines épigénétiques impliquées dans la régulation des gènes, (3) la régulation coordonnée de réseaux de gènes par des mécanismes épigénétiques et (4) la variabilité de l’organisation tridimensionnelle de l’ADN au sein des populations cellulaires et son influence sur l’expression des gènes dans des cellules individuelles.

Membres de l’équipe

Team_2019

Daan NOORDERMEER – Chef d’Equipe
Sébastien BLOYER – Professeur Université Paris-Sud
Li-Hsin CHANG – Chercheur Post-Doctorant
Joanne EDOUARD - Ingénieur d’Etude
Sourav GHOSH - Chercheur Post-Doctorant
Mélanie MIRANDA – Ingénieur d’Etude
Benoit MOINDROT –
           Maître de conférences Université Paris-Sud
Laura MONIOT PERRON – Doctorant
Julie SEGUENI - Etudiant M2


Projets de recherche

L’équipe Dynamique de la Chromatine a été fondée en 2014. Nous étudions comment la structure de l’ADN régule l’activité des gènes chez les mammifères. En particulier, nous nous intéressons aux fonctions régulatrices des mécanismes épigénétiques, des protéines insulatrices et l’organisation 3D du génome, et comment ces composantes agissent de concert. Pour répondre à ces questions, nous étudions des cellules de souris en utilisant une combinaison d’approches génomiques (ChIP-seq, Hi-C, 4C-seq), d’imagerie (microscopie fluorescente conventionnelle et confocale), de biochimie et de bio-informatique.


Publications récentes


- Llères, et al. (2019) CTCF controls imprinted gene activity at the mouse Dlk1-Dio3 and Igf2-H19 domains by modulating allele-specific sub-TAD structure. Genome Biology ; 20:272. Lien
- Shukron, et al. (2019) Statistics of chromatin organization during cell differentiation revealed by heterogeneous cross-linked polymers. Nature Communications ; 10:2626 Lien
- Greenberg, et al. (2019) Dynamic enhancer partitioning instructs activation of a growth-related gene during exit from naïve pluripotency. eLife ; 8:e44057
Lien
- Sobecki, et al. (2018) MadID, a versatile approach to map protein-DNA interactions, highlights telomere-nuclear envelope contact sites in human cells. Cell Reports ; 25:2891-2903.
Lien
- Vieux-Rochas, et al. (2015) Clustering of mammalian Hox genes with other H3K27me3 targets within an active nuclear domain. PNAS ; 112:4672-4677 Lien


Mots Clé

Organization tridimensionnelle de la chromatine , Modifications des histones, Protéines Insulatrices, Régulation des gènes, CTCF, TADs


Contact


NOORDERMEER Daan [Chargé de Recherche - CNRS]
Dynamique de la chromatine [Responsable]
01 69 82 31 38 Gif - Bât 26

publié le , mis à jour le