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Présentation de la Plateforme de Séquençage à haut débit



La plateforme de Séquençage à haut débit a été créée en janvier 2010 et est accessible à tous les utilisateurs académiques et industriels. Elle prend en charge l’intégralité de la prestation, de la préparation des librairies et du séquençage à l’analyse primaire des données.

• Elle propose à ses utilisateurs une large gamme de techniques pour la préparation de banques ADN et ARN et leur séquençage.
• Elle propose également des analyses bioinformatiques : cartographie et divers types d’analyses qui sont définies en accord avec les utilisateurs au début de chaque projet.
• Dans certains cas, pour des projets plus complexes, une collaboration peut être mise en place.
• La disponibilité des données est assurée par la plateforme pendant 2 mois.

Déroulement-type d’une prestation :
1- Discussion du projet entre le client et les membres de la plateforme, si nécessaire
2- Envoi de la fiche de demande de prestation par le client
3- Envoi du devis par la plateforme
4- Renvoi du devis signé et du bon de commande par le client
5- Dépôt des échantillons, Contrôle qualité des échantillons d’ARN ou ADN
6- Construction de banques
7- Séquençage
8- Analyse bioinformatique
9- Rapport de séquençage/ Envoi des données
10- Mise en paiement
La plateforme traite environ 150 projets par an, correspondant à plus de 700 banques et 40 projets analysés en bioinformatique.

La plateforme est certifiée ISO9001 depuis le 19 octobre 2015 et NFX 50-900 depuis le 6 novembre 2017.


Elle fait partie des réseaux IBiSA et France génomique.

Mots Clés :

Séquençage haut débit ; Illumina ; MinION ; banque ADN ; RNA-seq ; ChIP-seq ; bioinformatique



par Maud Silvain - publié le , mis à jour le