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Séquençage à haut débit

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Présentation de la Plateforme de Séquençage à haut débit

La plateforme de Séquençage à haut débit a été créée en janvier 2010 et est accessible à tous les utilisateurs académiques et industriels. Elle prend en charge l’intégralité de la prestation, de la (...)

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Offres d’emploi

Pas d’offre d’emploi actuellement.

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Services proposés

Les prestations offertes par la plateforme sont :
Construction de banques Illumina
DNA-seq, ChIP-seq
RNA-seq
small RNA-seq, miRNA-seq
Protocoles personnalisés en fonction de besoins (...)

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Tarifs

A noter :
la plateforme propose maintenant à ses utilisateurs de séquencer leurs échantillons sur le séquenceur GridION d’Oxford Nanopore Technologies, dans le cadre de projets collaboratifs. Pour (...)

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Fiches prestations

Séquençage Illumina Fiche prestation MiSEQ Fiche prestation NextSEQ La plateforme propose à ses utilisateurs de séquencer leurs échantillons par la technologie Nanopore dans le cadre de projets (...)

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Instructions pour la préparation des échantillons

Please read carefully these guidelines before preparing your material for sequencing
Samples should be in 1.5mL or 2mL tubes.
Write distinctly the sample codes received with your quote on the (...)

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Equipements

1 séquenceur Oxford Nanopore Technologies : GridION ;
2 séquenceurs Illumina : NextSeq 500 et MiSeq ;
Sonicateur Covaris, Bioanalyzer, Qubit ;
un cluster de calcul ;
2 stations de travail ; (...)

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Les membres

Le personnel de la plateforme est constitué de :
Directeur scientifique : Claude THERMES
Directeur technique : Erwin VAN DIJK
2 ingénieurs pour la construction et le séquençage des banques : (...)

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Publications

2019 :
Differentiation of derived rabbit trophoblast stem cells under fluid shear stress to mimic the trophoblastic barrier. Sanz G, Daniel N, Aubrière MC, Archilla C, Jouneau L, Jaszczyszyn Y, (...)

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Les outils bioinformatiques

CIRCUS is an R package implemented to analyze genomic structural variations. It generates both data and configuration files necessary for Circos, to produce graphs.
You can find the related (...)

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